Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA7

Sphk2, Sphingosine kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk2Q9JIA7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sphk2Q9JIA7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sphk2Q9JIA7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sphk2Q9JIA7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sphk2Q9JIA7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sphk2Q9JIA7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sphk2Q9JIA7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sphk2Q9JIA7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sphk2Q9JIA7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sphk2Q9JIA7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sphk2Q9JIA7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sphk2Q9JIA7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sphk2Q9JIA7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms