Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms