Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf3Q9ET30 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf3Q9ET30 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms