Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Zcchc17Q9ESX4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zcchc17Q9ESX4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zcchc17Q9ESX4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc17Q9ESX4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zcchc17Q9ESX4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zcchc17Q9ESX4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc17Q9ESX4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc17Q9ESX4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc17Q9ESX4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc17Q9ESX4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc17Q9ESX4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc17Q9ESX4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc17Q9ESX4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc17Q9ESX4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc17Q9ESX4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc17Q9ESX4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc17Q9ESX4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc17Q9ESX4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc17Q9ESX4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc17Q9ESX4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc17Q9ESX4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc17Q9ESX4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zcchc17Q9ESX4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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