Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tfip11Q9ERA6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tfip11Q9ERA6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms