Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cpsf1Q9EPU4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cpsf1Q9EPU4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms