Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms