Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rp2Q9EPK2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rp2Q9EPK2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms