Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP82

Wdr4, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit WDR4, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr4Q9EP82 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr4Q9EP82 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr4Q9EP82 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr4Q9EP82 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr4Q9EP82 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr4Q9EP82 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Wdr4Q9EP82 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms