Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap3s1Q9DCR2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms