Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmg20aQ9DC33 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmg20aQ9DC33 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmg20aQ9DC33 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmg20aQ9DC33 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmg20aQ9DC33 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmg20aQ9DC33 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmg20aQ9DC33 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmg20aQ9DC33 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmg20aQ9DC33 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmg20aQ9DC33 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmg20aQ9DC33 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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