Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrpraQ9DBG7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms