Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Pop5Q9DB28 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pop5Q9DB28 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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