Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actrt1Q9D9J3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms