Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D9D9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D9D9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D9D9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D9D9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q9D9D9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D9D9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D9D9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D9D9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D9D9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D9D9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms