Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms