Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2af1Q9D883 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms