Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7N3

Mrps9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps9Q9D7N3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrps9Q9D7N3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrps9Q9D7N3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms