Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmigd1Q9D7L8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms