Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpap3Q9D706 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpap3Q9D706 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpap3Q9D706 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpap3Q9D706 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpap3Q9D706 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpap3Q9D706 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpap3Q9D706 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpap3Q9D706 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpap3Q9D706 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpap3Q9D706 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpap3Q9D706 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpap3Q9D706 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpap3Q9D706 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpap3Q9D706 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpap3Q9D706 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpap3Q9D706 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpap3Q9D706 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpap3Q9D706 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpap3Q9D706 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpap3Q9D706 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpap3Q9D706 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpap3Q9D706 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpap3Q9D706 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpap3Q9D706 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms