Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gbe1Q9D6Y9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms