Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Borcs8Q9D6Y4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Borcs8Q9D6Y4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms