Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lpcat2bQ9D5U0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms