Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D5Q8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D5Q8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms