Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Ubxn11Q9D572 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Ubxn11Q9D572 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn11Q9D572 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Ubxn11Q9D572 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Ubxn11Q9D572 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn11Q9D572 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms