Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3a3Q9D554 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms