Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4931428L18RikQ9D4S9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4931428L18RikQ9D4S9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms