Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sohlh2Q9D489 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms