Protein–RNA interactions for Protein: Q9D485

Efhc2, EF-hand domain-containing family member C2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc2Q9D485 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Efhc2Q9D485 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efhc2Q9D485 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms