Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
4933428G20RikQ9D3X4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms