Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933428M09RikQ9D3X3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms