Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp5Q9D387 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp5Q9D387 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp5Q9D387 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp5Q9D387 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp5Q9D387 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp5Q9D387 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp5Q9D387 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp5Q9D387 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lamp5Q9D387 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp5Q9D387 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp5Q9D387 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp5Q9D387 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp5Q9D387 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp5Q9D387 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp5Q9D387 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp5Q9D387 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp5Q9D387 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp5Q9D387 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp5Q9D387 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp5Q9D387 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp5Q9D387 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp5Q9D387 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lamp5Q9D387 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lamp5Q9D387 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms