Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trappc6bQ9D289 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Trappc6bQ9D289 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc6bQ9D289 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc6bQ9D289 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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