Protein–RNA interactions for Protein: Q9D267

Lcn9, Epididymal-specific lipocalin-9, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn9Q9D267 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Lcn9Q9D267 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn9Q9D267 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Lcn9Q9D267 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Lcn9Q9D267 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Lcn9Q9D267 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Lcn9Q9D267 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn9Q9D267 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn9Q9D267 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn9Q9D267 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn9Q9D267 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Lcn9Q9D267 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Lcn9Q9D267 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Lcn9Q9D267 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Lcn9Q9D267 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn9Q9D267 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn9Q9D267 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn9Q9D267 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn9Q9D267 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn9Q9D267 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn9Q9D267 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn9Q9D267 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn9Q9D267 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn9Q9D267 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn9Q9D267 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn9Q9D267 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn9Q9D267 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn9Q9D267 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn9Q9D267 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn9Q9D267 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn9Q9D267 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn9Q9D267 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn9Q9D267 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn9Q9D267 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn9Q9D267 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn9Q9D267 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms