Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc167Q9D162 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc167Q9D162 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc167Q9D162 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc167Q9D162 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc167Q9D162 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc167Q9D162 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc167Q9D162 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc167Q9D162 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc167Q9D162 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc167Q9D162 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc167Q9D162 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc167Q9D162 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc167Q9D162 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc167Q9D162 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc167Q9D162 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc167Q9D162 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc167Q9D162 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc167Q9D162 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc167Q9D162 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc167Q9D162 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc167Q9D162 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc167Q9D162 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc167Q9D162 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc167Q9D162 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms