Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cmss1Q9CZT6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cmss1Q9CZT6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms