Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Utp11Q9CZJ1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms