Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nde1Q9CZA6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms