Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssu72Q9CY97 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms