Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms