Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Exo5Q9CXP9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Exo5Q9CXP9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms