Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RpainQ9CWY9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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