Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd4Q9CWX4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms