Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930535I16RikQ9CUI2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930535I16RikQ9CUI2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms