Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRY7

Gdpd1, Lysophospholipase D GDPD1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd1Q9CRY7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdpd1Q9CRY7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdpd1Q9CRY7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms