Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ska2Q9CR46 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ska2Q9CR46 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms