Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc43Q9CR29 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc43Q9CR29 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms