Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms