Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mri1Q9CQT1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mri1Q9CQT1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mri1Q9CQT1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mri1Q9CQT1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mri1Q9CQT1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mri1Q9CQT1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mri1Q9CQT1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms