Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Nicn1Q9CQM0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Nicn1Q9CQM0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Nicn1Q9CQM0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Nicn1Q9CQM0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Nicn1Q9CQM0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nicn1Q9CQM0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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